Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp964B2RR88 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms