Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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