Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms