Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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