Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms