Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp2c2A7L9Z8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2c2A7L9Z8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms