Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms