Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms