Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv30A0A0B4J1P1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv30A0A0B4J1P1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Trbv30A0A0B4J1P1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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