Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COPS7AQ9UBW8 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms