Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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