Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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