Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
CHCHD4Q8N4Q1 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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