Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf135Q5VTT2 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms