Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NRF1Q16656 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
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NRF1Q16656 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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NRF1Q16656 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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NRF1Q16656 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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NRF1Q16656 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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NRF1Q16656 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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NRF1Q16656 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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