Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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