Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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