Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
EEA1Q15075 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
EEA1Q15075 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms