Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1I3Q14994 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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NR1I3Q14994 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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NR1I3Q14994 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1I3Q14994 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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