Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD4Q14839 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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