Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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