Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBM39Q14498 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms