Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ALCAMQ13740 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms