Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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