Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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