Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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GPS1Q13098 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPS1Q13098 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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