Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNTN1Q12860 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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