Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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