Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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PTPRMP28827 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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PTPRMP28827 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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PTPRMP28827 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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PTPRMP28827 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
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PTPRMP28827 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
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PTPRMP28827 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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PTPRMP28827 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRMP28827 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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