Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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CEP290O15078 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CEP290O15078 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CEP290O15078 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CEP290O15078 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CEP290O15078 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CEP290O15078 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CEP290O15078 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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CEP290O15078 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
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CEP290O15078 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
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CEP290O15078 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CEP290O15078 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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CEP290O15078 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CEP290O15078 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CEP290O15078 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CEP290O15078 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CEP290O15078 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CEP290O15078 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
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