Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms