Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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ZBED3Q96IU2 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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ZBED3Q96IU2 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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ZBED3Q96IU2 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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ZBED3Q96IU2 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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ZBED3Q96IU2 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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ZBED3Q96IU2 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED3Q96IU2 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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