Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDO1Q16878 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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