Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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