Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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