Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NECTIN1Q15223 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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