Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCF4Q15080 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms