Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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