Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms