Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ITGA9Q13797 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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