Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TMED1Q13445 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms