Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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TCOF1Q13428 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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TCOF1Q13428 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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