Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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