Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SGCGQ13326 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms