Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIGQ13278 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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