| RPA4 | Q13156 | RNU6-57P-201 | ENST00000411348 | 103 nt | BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL162725.2-201 | ENST00000430545 | 748 nt | TSL 5 BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC073910.1-201 | ENST00000445047 | 438 nt | BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL160162.1-201 | ENST00000456715 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | LINC02233-201 | ENST00000513718 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-506P-201 | ENST00000516553 | 94 nt | BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC023200.1-201 | ENST00000519660 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC245505.1-201 | ENST00000556398 | 224 nt | BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC023043.2-201 | ENST00000589678 | 1026 nt | BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL138726.1-201 | ENST00000614873 | 333 nt | BASIC | 1.52 | □□□□□ -2.17 | | |
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| RPA4 | Q13156 | AL121890.5-201 | ENST00000620848 | 304 nt | BASIC | 1.51 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC006504.8-201 | ENST00000621046 | 635 nt | BASIC | 1.51 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 1.51 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC011604.2-202 | ENST00000540229 | 2451 nt | APPRIS P5 TSL 2 BASIC | 1.51 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.38-201 | ENST00000362617 | 102 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.517-201 | ENST00000384551 | 106 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR32-201 | ENST00000384965 | 70 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR487A-201 | ENST00000385009 | 80 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNAP23-203 | ENST00000397138 | 477 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | LINC01807-201 | ENST00000432481 | 676 nt | TSL 3 BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC027119.1-201 | ENST00000440877 | 241 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC025918.1-201 | ENST00000452467 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTND1P11-201 | ENST00000456661 | 876 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTND1P5-201 | ENST00000517906 | 940 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR4709-201 | ENST00000577272 | 72 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | B3GNTL1P2-201 | ENST00000603673 | 288 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | HS1BP3-208 | ENST00000631166 | 78 nt | TSL 5 BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | BCL2L11-225 | ENST00000640419 | 249 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTND5P35-201 | ENST00000557537 | 1720 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL161722.3-201 | ENST00000605789 | 2983 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MGAT4C-207 | ENST00000552808 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU4-24P-201 | ENST00000364565 | 139 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-60P-201 | ENST00000364792 | 103 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-534P-201 | ENST00000364877 | 106 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-417P-201 | ENST00000384712 | 107 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR517A-201 | ENST00000385001 | 87 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR153-2-201 | ENST00000385225 | 87 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNORA67.6-201 | ENST00000391093 | 99 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL590399.1-203 | ENST00000412631 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL590632.1-201 | ENST00000424289 | 371 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL355314.2-201 | ENST00000427182 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | LINC01710-201 | ENST00000446002 | 390 nt | TSL 5 BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU7-66P-201 | ENST00000459469 | 62 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC109635.3-201 | ENST00000529536 | 185 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC015688.6-201 | ENST00000577737 | 104 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | TP73-AS1.1-201 | ENST00000611447 | 161 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | SKIL-204 | ENST00000458537 | 7182 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | CENPQ-201 | ENST00000335783 | 1733 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | EMCN-202 | ENST00000305864 | 1575 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | BRDT-206 | ENST00000402388 | 3125 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.135-201 | ENST00000363439 | 95 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.287-201 | ENST00000364853 | 94 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.319-201 | ENST00000365138 | 92 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.414-201 | ENST00000384011 | 101 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-203P-201 | ENST00000384038 | 104 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-331P-201 | ENST00000384724 | 107 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNA5SP323-201 | ENST00000391094 | 133 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-332P-201 | ENST00000391193 | 108 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MRPL35P1-201 | ENST00000404272 | 572 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL513185.2-201 | ENST00000425543 | 193 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC008080.3-201 | ENST00000440074 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RPS29P23-201 | ENST00000458635 | 123 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-221P-201 | ENST00000459541 | 99 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC099513.1-201 | ENST00000490423 | 301 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNORA31.24-201 | ENST00000517232 | 57 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AP001496.1-201 | ENST00000579113 | 471 nt | TSL 4 BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR3937-201 | ENST00000580135 | 106 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL359757.2-201 | ENST00000624309 | 274 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | ZNF260-203 | ENST00000588993 | 4174 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU1-62P-201 | ENST00000362599 | 164 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-137P-201 | ENST00000363680 | 108 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1240P-201 | ENST00000365155 | 104 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1065P-201 | ENST00000384513 | 106 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR194-1-201 | ENST00000384892 | 85 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR181A1-201 | ENST00000385026 | 110 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNA5SP213-201 | ENST00000391031 | 106 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-373P-201 | ENST00000411247 | 98 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC005482.1-201 | ENST00000420758 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | RPS27P16-201 | ENST00000425758 | 201 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RPA4 | Q13156 | NAALADL2-AS1-201 | ENST00000426315 | 804 nt | TSL 5 BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |