Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPA4Q13156 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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