Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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