Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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HOXC5Q00444 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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HOXC5Q00444 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXC5Q00444 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
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