Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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