Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms