Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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